Nakon reforme neizravnih poreza i uvođenja PDV-a BiH je počela s reformom izravnih poreza.

U Republici Srpskoj još se od prošle godine primjenjuje novi zakon kojim se oporezuju osobna primanja građana, a primjena sličnog zakona u Federaciji BiH počinje 1. siječnja 2009. godine. Prema riječima premijera FBiH Nedžada Brankoviča, federalno ministarstvo financija započelo je kampanju kojom namjerava upoznati porezne obveznike i javnost o predstojećoj primjeni Zakona o porezu na dohodak u FBiH, koji je usvojen početkom godine. Zakon o porezu na osobna primanja uvodi novi sustav oporezivanja. Njime je predviđeno oporezivanje prihoda od samostalnih djelatnosti – dobiti fizičkih osoba, prihoda od poljoprivrede i šumarstva, od autorskih prava, patenata i tehničkih unapređenja, zatim od imovine i imovinskih prava, kapitala te od dobitaka u nagradnim igrama i igrama na sreću. Od oporezivanja su izuzeti jedino građani koji ostvaruju prihode od mirovina, zatim na osnovi socijalnih potpora te na osnovi posebnih propisa o pravima ratnih vojnih invalida i civilnih žrtava rata. Od oporezivanja su izuzeti i službenici Ureda visokog predstavnika međunarodne zajednice u BiH. Zakon propisuje jedinstvenu poreznu stopu na primanja od 10 posto mjesečno, s tim što je neoporezivi dio plaće 300 KM. Neoporezivi dio može biti i veći, ovisno o visini takozvanog osobnog odbitka, a to su u principu olakšice na osnovi broja izdržavane djece u kućanstvu, izdržavanja bračnog partnera, invalida u kućanstvu i slično. Olakšice se tehnički ostvaruju na osnovi porezne kartice. Federalni ministar financija Vjekoslav Bevanda i njegov pomoćnik za fiskalnu i poreznu politiku Hajrudin Hadžimehanović najavili su neku vrstu edukacije novinara koji prate rad tog ministarstva kako bi oni porezne obveznike što bolje upoznali o predstojećim pravima i obvezama iz novog zakona. Uz reformu izravnih poreza federalna vlada najavljuje i smanjenje stope doprinosa za mirovinsko i zdravstveno osiguranje čim broj zaposlenih prijeđe brojku od 500.000 (sada je u FBiH zaposleno 490.000). Kako bi poboljšala uvjete poslovanja uz provedbu projekta nazvanog Giljotina propisa, najavljeno je i uvođene jedinstvenog servisa za poduzetnike koji bi funkcionirao po načelu “one stop shopa”.