Odluke o ostvarenju prava na izravna plaćanja u poljoprivredi nisu donesene zbog čega korisnici potpore ne raspolažu podacima o ostvarenim pravima na izravna plaćanja po sektorima i vrstama plaćanja, umanjenjima s osnova modulacije te konačnom obračunu, jedna je od konstatacija Državnog ureda za reviziju u ocjeni rada Ministarstva poljoprivrede za 2012./2013. godinu. Prigovorili su i radi 48 ugovora o djelu vanjskih suradnika na administrativno-računovodstvenim poslovima jer su trajali neprekidno više od jedne godine.

Državni ured za reviziju nalaže obavljanje poslova, iz djelokruga Ministarstva, povjeriti državnim službenicima ili namještenicima u skladu s odredbama zakona o državnim službenicima. Nalaže ugovaranje poslova putem ugovora o djelu do zakonom propisanog ograničenja od godinu dana. Nepravilnosti i propusti utvrđeni revizijama prethodnih godina koji nisu otklonjeni kao i utvrđeni revizijom za 2013. koji se odnose na računovodstveno poslovanje, rashode za subvencije i koncesije, dijelom su posljedica nezadovoljavajućeg funkcioniranja unutarnjih financijskih kontrola pa su, ističu revizori, utjecali na izražavanje uvjetnog mišljenja.