Hrvatske vode su pravna osoba za upravljanje vodama, osnovane Zakonom o vodama radi trajnog i nesmetanog obavljanja javnih službi i drugih poslova kojima se ostvaruje upravljanje vodama u opsegu utvrđenom planovima i u skladu sa sredstvima.

To su osobito: priprema podloga za kreiranje vodne politike, priprema programa, planova i drugih akata koji čine osnovu za osiguravanje dovoljnih količina odgovarajuće vode za različite namjenske potrebe, zaštitu voda od onečišćenja, uređenje vodotoka i drugih voda i zaštitu od štetnoga djelovanja voda, investitorski i drugi poslovi kojima se izvršavaju ti programi i planovi, te poduzimanje mjera kojima se osigurava racionalno korištenje voda, zaštita voda i zaštita od poplava i drugih oblika štetnoga djelovanja voda. Uz Zakon o vodama poslovanje Hrvatskih voda uređeno je i Zakonom o financiranju vodnoga gospodarstva. Uz Direkciju koja ima zadatak osigurati funkcionalno jedinstvo, učinkovitost i koordinaciju svih ustanovljenih jedinica Hrvatskih voda na razini Republike Hrvatske, Hrvatske vode su teritorijalno organizirane po vodnogospodarskim odjelima i vodnogospodarskim ispostavama osnovanim sa zadaćom operativnog upravljanja vodama na terenu. Misija Hrvatskih voda je upravljati vodama u Republici Hrvatskoj radi zaštite života, zdravlja i imovine od štetnog djelovanja voda. Također radi osiguranja trajne dostupnosti voda optimiziranjem ekonomskih i ekoloških koristi na načelima održivoga razvitka. Vizija Hrvatskih voda je kontinuirano ostvarivati svoju misiju i postizati zadane ciljeve, poštivajući najviše standarde kvalitete, koristeći suvremene znanstvene i emprijiske tehnologije i metode koje su prijateljske okolišu i prirodi, ostvariti najviši stupanj suglasnosti s korisnicima i dionicima voda o ciljevima i načinima očuvanja vode i zaštite od voda.

Misija je i razviti svijest o vodi kao strateškom resursu te afirmirati se kao stručna i vjerodostojna nacionalna agencija za upravljanje vodama. U provedbi vlastite misije i ostvarenju vizije Hrvatske vode kontinuirano podižu i traže kvalitetu, približavaju svoje poslovanje korisnicima voda, dionicima voda, zainteresiranoj javnosti i ukupnoj javnosti. Hrvatske vode nastavljaju ostvarivati uravnoteženo pravilno, svrhovito, učinkovito, ekonomično i transparentno financijsko poslovanje koje se u prvom redu temelji na izvornim i autonomnim prihodima iz vodnih naknada, poštivajući njihovu namjenu i namjenu proračunskih sredstava, provodeći propisane zabrane i ograničenja zaduživanja i poštivajući opseg ugovaranja u granicama važećega financijskog plana i plana upravljanja vodama. Hrvatske vode također povećavaju učinkovitost svog poslovanja kroz svrhovito unutarnje ustrojstvo, upravljanje i razvoj ljudskih potencijala, uključujući i stalno stručno usavršavanje, pravilnu i pravičnu preraspodjelu radnih poslova i zadataka, vodeći pritom računa o načelu supsidijarnosti. Tvrtka unapređuje ukupno poslovanje uvođenjem suvremenih informatičkih rješenja te unapređenjem poslovnih procesa. U Hrvatskim vodama danas je zaposleno oko 800 radnika od kojih više od 65 posto imaju visoku i višu stručnu spremu različitih struka, najviše građevinske, ekonomske i pravne, a potom biološke, kemijske, tehnološke, agronomske i druge.Hrvatskim vodama upravlja glavni direktor kojeg imenuje Vlada Republike Hrvatske i sedmeročlano Upravno vijeće, od kojih šest članova imenuje Vlada Republike Hrvatske, a jednog člana Radničko vijeće.